Partizionare Ubuntu su USB

La domanda è questa, ho installato ubuntu su una pendrive USB e funziona perfettamente, ma quando lo collego a un pc windows, questo non la riesce a riconoscere, a causa della formattazione ext4, allora ho provveduto a partizionare la Pendrive in 3 parti: 45GB FAT32 (dati), 12GB ext4 (OS) e 2GB di swap. questo per poter usare ubuntu e salvare i file sulla parte FAT32 in modo da renderli accessibili a qualsiasi altro PC. il problema sta che non riesco a spostare tutte le cartelle nella pennina USB (ad esempio la cartella immagini, documenti e musica). io desidero che quando vado a scaricare un file esso vada autonomamente nella cartella giusta (scarica) ma che questa cartella si trovi al contempo nella partizione giusta. ho provato con i miei mezzi a vedere se risolvevo, ma il problema a quanto ho capito sta nel fatto che non riesce a montare la partizione FAT32 all'avvio, e quindi non riesce a mantenerci le cartelle di sistema. Conoscete qualche soluzione? Grazie in anticipo :)