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Salve a tutti, spero possiate aiutarmi. Sto svolgendo delle analisi di bioinformatica usando Ubuntu ed è la prima volta dei tempi dell'università che mi capita di usarlo quindi sono un pò in difficoltà. Dunque sto provando ad usare un programma per costruire una "average amino acid identity matrix" di cui ho scaricato la stringa di comando da GitHub. Ho installato il programma su un environment conda come richiesto e anche i pacchetti accessori. Ho creato una directory con i miei file in formato .fasta e ho provato a lanciare il programma. Tuttavia ogni volta mi da un messaggio di errore, in cui dice questo "No genomes found in directory: input_AAI. Check the --file_ext flag used to identify genomes". Io ho controllato più volte il formato dei file, il percorso della directory, i permessi, ma nulla. Non riesco davvero a capire cosa non vada. Spero di essere stata chiara e che qualcuno possa darmi qualche consiglio, grazie in anticipo |
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domanda posta: 14 Nov, 16:45
domanda visualizzata: 49 volte
ultimo aggiornamento: 26 Nov, 18:17
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credo che non sei nel posto giusto,"per questa domanda" io purtroppo non sono all'altezza di aiutarti,questa domanda meglio farla nella stanza di fianco cioè il "forum" sezione programmazione
Saluti